Een groot verschil tussen bioraffinage en aardolieraffinage is dat men al meer dan 50 jaar ervaring heeft met aardolieraffinage, terwijl veel nieuwe bioraffinageconcepten nog in ontwikkeling zijn of nog ontwikkeld moeten worden. Daarnaast vindt bioraffinage doorgaans plaats op een veel kleinere schaal en met compleet andere apparatuur. Het idee erachter is dus hetzelfde maar de uitvoering verschilt dag en nacht. In de Bio Based economy probeert men bioraffinage verder te ontwikkelen en te verbeteren.



Net zoals met de aardolieraffinage heeft ook bioraffinage tot doel de groene grondstof, in dit geval biomassa, uiteen te rafelen en de verschillende fracties verder te bewerken zodat de biomassa volledig benut kan worden.